了解SARS-CoV-2 的演變對(duì)于預(yù)測(cè)疫苗突破以及設(shè)計(jì)抗突變疫苗和單克隆抗體治療至關(guān)重要。在最近的一項(xiàng)研究《ACS傳染病》 中,研究人員分析了來(lái)自COVID-19 患者的近150 萬(wàn)個(gè)SARS-CoV-2 基因組序列。他們?cè)谑荏w結(jié)合域(RBD)中發(fā)現(xiàn)了683 個(gè)獨(dú)特的突變,RBD 是SARS-CoV-2 刺突蛋白的區(qū)域,附著在人類(lèi)細(xì)胞表面的人類(lèi)ACE2 受體上。
然后,他們使用人工智能模型來(lái)預(yù)測(cè)這些突變?nèi)绾斡绊慠BD 與ACE2 以及130 種抗體結(jié)構(gòu)(包括幾種用作治療的單克隆抗體)結(jié)合的強(qiáng)度。研究小組發(fā)現(xiàn),增強(qiáng)傳染性的突變是病毒進(jìn)化的驅(qū)動(dòng)因素,而使病毒逃避疫苗的突變?cè)诟叨冉臃N疫苗的人群中占主導(dǎo)地位。研究人員還預(yù)測(cè),某些突變組合很可能廣泛傳播。
在期刊《化學(xué)信息與建模雜志》 的另一項(xiàng)研究中,研究人員對(duì)Omicron 變種的感染性、疫苗突破和抗體耐藥性進(jìn)行了深入分析。他們使用人工智能模型來(lái)分析該變體刺突蛋白上異常多的突變?nèi)绾斡绊慠BD 與ACE2 和抗體的結(jié)合。他們的結(jié)果顯示,Omicron 的傳染性比原始冠狀病毒高10 倍以上,比Delta 變種的傳染性高2.8 倍。此外,Omicron 比Delta 更有可能逃避現(xiàn)有疫苗,并且預(yù)計(jì)會(huì)損害幾種單克隆抗體療法的功效。研究人員表示,其中許多預(yù)測(cè)已被新出現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果所證實(shí),這強(qiáng)調(diào)了開(kāi)發(fā)不易受病毒突變影響的新一代疫苗和單克隆抗體的重要性。