進入21世紀后,人們逐漸意識到生物甲烷的形成過程遠比這個故事復(fù)雜得多。產(chǎn)甲烷古菌并不是唯一能夠產(chǎn)生甲烷的細菌,而且反應(yīng)條件并不局限于缺氧環(huán)境。從藻類和藍藻到多細胞真菌和植物,越來越多的證據(jù)表明多種需氧生物都可以產(chǎn)生甲烷。但這些生物體究竟如何產(chǎn)生甲烷仍然未知。
在本周發(fā)表在《自然》 雜志上的一項新研究中,德國海德堡大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一個團隊提出了一個改變游戲規(guī)則的想法:所有生物,包括人類,都是甲烷的產(chǎn)生者。這一結(jié)論不僅讓我們重新認識甲烷在生命過程中的作用,也將為許多領(lǐng)域帶來新的見解。
早在8年前,該團隊就在論文《自然·通訊》中描述了通過非生物途徑產(chǎn)生甲烷的三步過程。簡單來說,這個反應(yīng)不需要酶的參與,主要原料只有三種:活性氧(ROS)、游離鐵和合適的甲基供體。
整個反應(yīng)過程并不復(fù)雜:首先,ROS(該反應(yīng)使用過氧化氫)與亞鐵離子反應(yīng),產(chǎn)生高度還原的羥基自由基(·OH);然后,羥基自由基與甲基供體反應(yīng),形成甲基自由基(·CH3);最后,甲基自由基與氫自由基(·H)結(jié)合生成甲烷分子。
在實驗室揭示了這種甲烷生成過程后,研究小組提出了一個大膽而有趣的想法。在活體中,這些原料并不少見(例如,包括過氧化氫在內(nèi)的ROS也在細胞中不斷產(chǎn)生和釋放,游離鐵和甲基供體也是常見的代謝產(chǎn)物),細胞環(huán)境也與上述有關(guān)實驗室反應(yīng)條件相似。那么,這種產(chǎn)甲烷過程也能發(fā)生在生物體中嗎?
這種無需酶參與就能產(chǎn)生甲烷的反應(yīng),展示了細胞內(nèi)的過程(圖片來源:參考文獻[2])
在最新的研究中,研究團隊首先使用枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)來測試這一猜想。該細菌的生命周期由兩個狀態(tài)組成:休眠和生殖生長,因此可以將其作為對照來研究代謝過程是否可以產(chǎn)生甲烷。
實驗結(jié)果非常明確:在含有甲基供體二甲亞砜(DMSO)的培養(yǎng)基中,在沒有任何酶參與的情況下,枯草芽孢桿菌在生殖生長期且代謝旺盛時能夠持續(xù)產(chǎn)生甲烷,而在休眠期細菌不產(chǎn)生甲烷。
隨后的控制變量實驗表明,這些細菌可用的甲基供體和游離體的含量在調(diào)節(jié)最終甲烷產(chǎn)量方面也發(fā)揮著重要作用。特別值得注意的是,除了新陳代謝更強之外,當氧化應(yīng)激發(fā)生時,即過量的ROS導(dǎo)致細胞無法維持氧化還原平衡,細菌甲烷的產(chǎn)生也會增加。
進一步的實驗證實,不僅僅是枯草芽孢桿菌可以通過這個過程產(chǎn)生甲烷。從以前被認為不會產(chǎn)生甲烷的其他古細菌,到酵母和粘菌等真菌;從代表植物界的葡萄到人類來源的細胞系(人胚胎腎細胞),它們都可以在DMSO培養(yǎng)基中產(chǎn)生甲烷,并且在氧化應(yīng)激條件下甲烷產(chǎn)量更高。因此,研究表明,也許所有經(jīng)歷新陳代謝的生物體都可以通過這個普遍的過程在其細胞內(nèi)繼續(xù)產(chǎn)生甲烷。
實驗室中不同生物細胞產(chǎn)生的甲烷濃度(圖片來源:參考資料[1])
如果這一猜想最終得到證實,那么一系列的生命活動有望得到新的解釋。在生物體中,當新陳代謝產(chǎn)生的ROS大量積累時,可能會對DNA、RNA和蛋白質(zhì)等重要分子造成損害。這個新發(fā)現(xiàn)的過程可能是消除多余ROS的一種方法。
論文通訊作者之一、海德堡大學(xué)教授Frank Keppler 表示:“我們的發(fā)現(xiàn)將成為理解有氧甲烷產(chǎn)生的里程碑。這種一般機制也將解釋之前在植物中觀察到的現(xiàn)象?!?
值得注意的是,在之前的研究中,即使是同一個生物體,不同個體的甲烷產(chǎn)量也可能存在幾個數(shù)量級的差異。最新研究揭示的機制或許可以解釋這一現(xiàn)象。 ——產(chǎn)生極高的甲烷可能是因為個體正在進行活躍的代謝活動。
可以說,這一意外的發(fā)現(xiàn)在廣泛的領(lǐng)域都具有重大意義。在醫(yī)學(xué)上,細胞中過量的甲烷以及通過組織擴散可以表明細胞應(yīng)激、氧化還原失衡等。“呼吸中甲烷的波動可以反映氧化應(yīng)激水平或指向免疫系統(tǒng),”開普勒教授說。在氣候領(lǐng)域,目前還不清楚這一過程產(chǎn)生的甲烷是否會對全球氣候產(chǎn)生影響。但我們很清楚,這種常見氣體的發(fā)現(xiàn)將為我們了解自己和世界打開一扇全新的窗戶。