根據(jù)海水樣本,研究人員發(fā)現(xiàn)了大量具有多樣性的新病毒,因此他們建議將RNA 病毒所需的類群數(shù)量從現(xiàn)有的5 個門增加一倍到10 個門。據(jù)悉,門分類是生物學中一個廣義的分類概念,隸屬于界分類。
微生物學家在海洋中發(fā)現(xiàn)了大量多樣性的新病毒,甚至發(fā)現(xiàn)了一個完整的病毒門———— Taraviricota,它們分布在世界各地的所有海域,表明它們在海洋生態(tài)中的重要性。
RNA病毒的研究通常集中在那些引起疾病的病毒上(眾所周知的RNA包括:流感病毒、埃博拉病毒和新型冠狀病毒等)。然而,它們只是地球上RNA病毒的“冰山一角”。目前,我們想要非常大規(guī)模地系統(tǒng)研究海洋病毒,探索以前沒有探索過的新領(lǐng)域,揭示更多海洋病毒的奧秘。
該研究報告發(fā)表在4月7日出版的期刊《科學》上。研究人員分析了來自世界五大洋121 個地區(qū)的35,000 個海洋樣本。研究人員表示,他們檢查了從浮游生物(RNA 病毒的常見宿主)中提取的基因序列。通過尋找一種名為RdRp 的古老基因,他們找到了屬于RNA 病毒的序列。 RdRp 存在于所有RNA 病毒中,但不存在于其他病毒和細胞中。最終,他們鑒定出了超過44,000 個含有該基因的病毒序列。
但RdRp基因已經(jīng)有數(shù)十億年的歷史,并且已經(jīng)進化了很多次。由于基因的進化可以追溯到很久以前,研究人員很難確定基因序列之間的進化關(guān)系。因此,研究人員利用機器學習來幫助組織它們。
總體而言,他們鑒定了大約5,500 種新的RNA 病毒,屬于5 個現(xiàn)有的門,以及5 個新提出的門,研究人員將其命名為:Taraviricota、Pomiviricota、paraxenviricota、Wamoviricota 和Arctiviricota。其中,Taraviricota門病毒種類較多,分布于溫帶和熱帶海域,而Arctiviricota門病毒則集中在北冰洋。
了解RdRp 基因如何隨時間演化可以幫助我們了解地球早期生命如何演化。 RdRp 基因被認為是最古老的生物基因之一,在生物體需要DNA 之前就已存在。所以我們不僅是在追蹤分析病毒的起源,更是在追蹤生命的起源!